g_ryurikov: (Default)
Друзья, нужна помощь зала. Есть идея составить список научпоп-книг по биологии, причём максимально релевантный. То есть это должны быть не просто книги «я прочитал и вроде ничё так», а стоит задача выделить в первую очередь «мастриды», и облако следующих за ними более специфичных вещей. Есть идеи? Пишите в комменты, всем заранее спасибо.

У меня пока что есть такой, он сильно неполный, хотелось бы больше и объективнее.
https://barson.livejournal.com/176372.html
g_ryurikov: (Default)



Базовые сведения об эволюционной биологии всем нам известны как минимум из школьных учебников. Разные формы клюва у дарвиновых вьюрков, и форма черепа неандертальцев, и рудименты таза у кита… Но современная наука об эволюции располагает ещё огромным арсеналом средств, обретённых в последние десятилетия. О действии естественного отбора можно судить по проценту несинонимичных замен, самые надёжные свидетельства о степени родства разных видов получаются опять же на основе анализа специальных маркеров в их ДНК, и даже про общего предка всего живого проще всего говорить, имея в виду его геном. Поговорим о том, какие главные идеи и возможности лежат в основе методов современной эволюционной биологии.
g_ryurikov: (Default)



Альтруизм с точки зрения эволюции: баг или фича?

Утверждение 1: В основе механизма эволюции лежит дарвиновское «выживание наиболее приспособленного». Да, можете проверить, современная наука считает именно так.

Утверждение 2: Альтруизм существует. И он широко распространён в природе. В смысле да — инстинктивное (т. е. наследственно обусловленное) поведение, направленное на увеличение чужой индивидуальной приспособленности в ущерб собственной.

НО КАК???

Отмашку к началу эпических батлов об эволюционных механизмах возникновения альтруизма дал сам Дарвин, высказавшийся на этот счёт довольно туманно. И уже в девятнадцатом веке Пётр Кропоткин яростно спорит с «бульдогом Дарвина» Томасом Гексли, противопоставляя идее об эволюции как «войне каждого против всех» свою «взаимопомощь как фактор эволюции». В двадцатом веке появляется классическая этология — и Конрад Лоренц пишет об инстинктах на «благо вида», о котором столь неосторожно упоминал Дарвин. Винн-Эдвардс формулирует теорию «группового отбора» и «узаконивает» альтруизм в эволюции. Но практически сразу после этого появляется теория родственного отбора, и Ричард Докинз (по аналогии с Гексли прозванный «ротвейлером Дарвина») обрушивается на групповой отбор, не оставив от него, кажется, камня на камне. Джордж Прайс выводит уравнение, математически доказывающее, что альтруизм — это завуалированный эгоизм, и кончает самоубийством. Так что же, все окончательно решено? Не совсем; уже в двадцать первом веке Эдвард Уилсон, крупнейшая фигура эволюционной этологии и создатель «социобиологии», продолжает оппонировать Докинзу и отстаивать возможность группового отбора.

https://kocherga-club.ru/#schedule
https://kocherga.timepad.ru/event/923055/
g_ryurikov: (Default)



В "Кочерге" в ближайшую среду срываю покровы с устройства современной науки об эволюции. Приходите! :)

https://kocherga.timepad.ru/event/878785
(предварительная регистрация не обязательна)

Эволюция? Да, конечно. Все мы об этом знаем. Как же её сейчас изучают? Как, например, эволюционные биологи судят о действии естественного отбора? По появлению у организмов изумительных приспособлений? Хм, ну, скорее, по проценту несинонимичных нуклеотидных замен. А что известно о том, как выглядел общий предок всего живого? Ну, скорее всего, он никак не выглядел, хотя можно интересно и содержательно поговорить о его геноме. Наконец, происходит ли человек от обезьяны? Ну, это совсем неинтересно. Интереснее — в какой мере человек происходит от бактерий, а в какой от вирусов?
g_ryurikov: (Default)
Что может быть проще, чем задачи по генетике? Если, конечно, понимать, как их решать. К сожалению, за словом «понимаю» слишком часто стоит привычка совершать какие-то псевдомагические действия, совершенно не вникая в их смысл. К такого рода псевдомагическим действиям относится рисование так называемой решётки Пеннета — замечательный лайфхак, делающий решение многих задач простым и наглядным. Одна беда — если «разрешать» решётке решать задачу за тебя, последствия могут быть непредсказуемыми. Там же как — надо что-то такое нарисовать, а потом просто пересчитать нужные клеточки. Я помню, когда я учился в первом классе, мы пользовались счётными палочками. Это чтобы посчитать что-нибудь. Дают тебе пример: сколько будет 3+3? Берёшь такой, отсчитываешь: раз, два, три палочки. Потом добавляешь к ним ещё: раз, два, три палочки. И пересчитываешь, сколько получилось: раз, два, три, четыре, пять, шесть палочек. Хотя во втором классе так делать уже как-то неприлично. Почему же в генетике это делают и в одиннадцатом, пальцем пересчитывая нарисованные клеточки? Самое простое и неприятное, что при этом может произойти — можно просто ошибиться при таком пересчёте. Если клеточек много, да ещё и нарисована решётка не очень аккуратно, люди ошибаются очень часто. Получил неправильный ответ — и не знаешь, что он неправильный. Обидно.



Какова на самом деле логика, которую использует решётка? Например, на приведённой картинке, которая есть в каждом учебнике и иллюстрирует вывод третьего закона Менделя. Каким образом можно узнать, какова будет частота в потомстве двух родителей-дигетерозигот (AaBb x AaBb) генотипа aabb (зелёные морщинистые семена)? Для того, чтобы получился потомок aabb нужно, чтобы гамета ab встретилась с гаметой ab. Каждый из четырёх типов гамет у каждого родителя равновероятен, и вероятность эта составляет 1/4. То есть с вероятностью 1/4 появляется «нужная» яйцеклетка, и в 1/4 из них нам «повезёт» и со сперматозоидом тоже. Вероятность такого совпадения составляет 1/16, это и есть частота генотипа aabb. Так вычисляется вероятность каждого из вариантов встречи гамет, то есть каждой клеточки в решётке. «Озвучивая» для себя эту логику, мы следуем очень хорошему правилу — цифры в ответе всегда должны быть результатом вычислений, а не магических действий. Если мы получаем «на выходе» цифры, значит, у нас были какие-то цифры «на входе». Кстати, расщепление, получаемое в третьем законе Менделя (9:3:3:1), элементарно выводится и без рисования решётки. Логика здесь такая. Признаки у нас независимы, это значит, что среди жёлтых семян такой же процент морщинистых, как и среди зелёных, и как и среди всех семян. И наоборот: среди морщинистых такой же процент жёлтых, как и среди гладких, и как и среди всех. Для вычисления долей по каждому признаку в отдельности мучиться не надо: их предсказывает второй закон Менделя (3:1). Ведь если мы рассматриваем только цвет, то имеем деле со скрещиванием Аа х Аа. А если только форму, то Bb х Bb. Итак, например, зелёных семян у нас четверть. Морщинистых семян тоже четверть. Сколько зелёных морщинистых? Если зелёных четверть, то четверть из них морщинистые, это даёт 1/16. Сколько жёлтых гладких? Жёлтых 3/4, гладких из них тоже 3/4, это даёт 3/4*3/4=9/16. Жёлтых у нас 3/4, из них морщинистых 1/4, то есть 3/4*1/4=3/16. Ну и зелёных 1/4, из них гладких 3/4, это даёт 1/4*3/4=3/16. И никакого пересчитывания клеточек пальцами.

Вычисления, которые «производит» решётка, более громоздкие. Решётка «вычисляет» вероятность каждой клеточки, потом клеточки с совпадающими результатами складываются. Но если честно проговаривать про себя все вычисления, то ошибки не будет. Начинаются эти вычисления с «входных» данных, что вероятности всех гамет равны 1/4 (то есть «все строки одинаковой высоты, и столбцы одинаковой ширины). Но если, скажем, взять задачу на сцепленное наследование с кроссинговером, то вероятности гамет будут различны. Например, скрещиваем дигетерозиготных родителей (AaBb x AaBb). Гены сцеплены, пусть у обеих особей доминантные гены находятся в одной хромосоме, рецессивные — в другой. Кроссинговер 20%. Это означает, что у каждого из родителей появляется четыре типа гамет: AB 40%, ab 40%, Ab 10%, aB 10%. Эти цифры и придётся использовать, вычисляя вероятность каждой клеточки в решётке. Но у нарисованной на бумаге решётки площадь каждой клеточки одинакова, и это может сбивать с толку. Но если понимать, что делаешь, и почему делаешь именно так, то всё будет хорошо.

g_ryurikov: (Default)



ГМО. Страшная сказка для непослушных детей, зараза двадцать первого века, ужас и спасение человечества. Что заставляет производителей писать на этикетках «не содержит ГМО»? Что думают покупатели? Что думают учёные-генетики? Что на самом деле стоит за этим словом из трёх букв, что мы об этом знаем, и какие выводы можем сделать из этого знания? И, наконец, почему разные люди делают настолько разные выводы, и никак не могут договориться друг с другом?

Лектор: Георгий Рюриков, выпускник биологического факультета МГУ, сотрудник института проблем экологии и эволюции РАН.

***
Встреча пройдёт в среду 14 ноября, в 19:30, в антикафе Кочерга. Оплата участия — по тарифам антикафе: 2,5 руб./минута. Регистрация: https://kocherga.timepad.ru/event/851010
g_ryurikov: (Default)


Москва, 9 июня (в субботу) в 18:00 состоится лекция-дискуссия "Сепульки, аллели и одноклеточные млекопитающие"

Попробуем немного по-новому взглянуть на азы школьной биологии. Каждый из наших родителей передал нам часть своего генетического материала. Логично, что про большинство признаков у нас в результате «сказано» дважды. Гены, таким образом «дублирующие» друг друга, называются аллельными. Хромосомы, в которых они находятся, называются гомологичными. Набор хромосом, содержащий пары гомологичных хромосом, называется диплоидным. Кроме того, как хорошо известно, сепульки очень похожи на муркви, а своей цветовой гаммой напоминают мягкие пчмы. А аллели обычно проще всего распознать как обозначающиеся заглавным или строчным вариантом одних и тех же буковок. Да?

Лектор: Георгий Рюриков, выпускник биологического факультета МГУ, сотрудник института проблем экологии и эволюции РАН.

Мероприятие пройдет по адресу: Российская Государственная Библиотека Молодёжи, м. Преображенская площадь, улица Большая Черкизовская, дом 4, корп. 1

http://www.rgub.ru
g_ryurikov: (Default)


Москва, 2 июня (в субботу) в 16:00 состоится лекция-дискуссия "Наследственность: существует ли ген убийцы"

Наследуется ли цвет глаз? Наследуется ли гемофилия? Наследуются ли выдающиеся музыкальные способности? Наследуется ли длина носа? Наследуется ли пол? Наследуется ли коэффициент интеллекта? Что не так с этим списком? В нём есть ошибка. Что такое наследственность? Это не так очевидно, как кажется. И, наконец, спойлер: наследуется ли отрезанный хвост? Наследуется.

Лектор: Георгий Рюриков, выпускник биологического факультета МГУ, сотрудник института проблем экологии и эволюции РАН.

Мероприятие пройдет по адресу: Российская Государственная Библиотека Молодёжи, м. Преображенская площадь, улица Большая Черкизовская, дом 4, корп. 1

http://www.rgub.ru
g_ryurikov: (Default)


Попробуем немного по-новому взглянуть на азы школьной биологии. Каждый из наших родителей передал нам часть своего генетического материала. Логично, что про большинство признаков у нас в результате «сказано» дважды. Гены, таким образом «дублирующие» друг друга, называются аллельными. Хромосомы, в которых они находятся, называются гомологичными. Набор хромосом, содержащий пары гомологичных хромосом, называется диплоидным. Кроме того, как хорошо известно, сепульки очень похожи на муркви, а своей цветовой гаммой напоминают мягкие пчмы. А аллели обычно проще всего распознать как обозначающиеся заглавным или строчным вариантом одних и тех же буковок. Да?

Лекция рассчитана на широкую аудиторию.

Лектор: Георгий Рюриков, выпускник биологического факультета МГУ, сотрудник института проблем экологии и эволюции РАН.

Встреча пройдёт в среду 16 мая, в 19:00, в антикафе Кочерга. Оплата участия — по тарифам антикафе: 2,5 руб./минута.

Регистрация: https://kocherga.timepad.ru/event/722481

https://vk.com/kocherga_biology?w=wall-113719989_206
g_ryurikov: (Default)


Наследуется ли цвет глаз? Наследуется ли гемофилия? Наследуются ли выдающиеся музыкальные способности? Наследуется ли длина носа? Наследуется ли пол? Наследуется ли коэффициент интеллекта? Что не так с этим списком? В нём есть ошибка. Что такое наследственность? Это не так очевидно, как кажется. И, наконец, спойлер: наследуется ли отрезанный хвост? Наследуется.

Лекция рассчитана на широкую аудиторию.

Лектор: Георгий Рюриков, выпускник биологического факультета МГУ, сотрудник института проблем экологии и эволюции РАН.

Встреча пройдёт в пятницу 4 мая, в 20:00, в антикафе Кочерга. Оплата участия — по тарифам антикафе: 2,5 руб./минута. Регистрация: https://kocherga.timepad.ru/event/713783


https://vk.com/georgy.ryurikov?w=wall26073961_686%2Fall
g_ryurikov: (Default)
В ближайшую среду в "Кочерге" вещаю про философские аспекты механизма наследственности. :) Приходите!



https://kocherga.timepad.ru/event/689741/

...

Feb. 28th, 2018 12:39 pm
g_ryurikov: (Default)
65 лет назад, 28 февраля 1953 года, Френсис Крик в кембриджском пабе впервые заявил о "раскрытии секрета жизни"

June 2019

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
232425262728 29
30      

Syndicate

RSS Atom

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 4th, 2025 10:19 pm
Powered by Dreamwidth Studios